Hast du den RCon Port in deiner Firewall freigegeben?
Welchen Path hast du in deiner Startdatei zum Battleye Ordner angegeben?
Wenn du mir sagen kannst wo ich das nochmal einstellen kann genau kann ich es dir vlt sagen 
Du solltest in deinem Server Verzeichnis, sprich dort wo die arma3server.exe oder die arma3server liegt eine Startdatei haben. In dieser sollte der Parameter -bepath mit deinem Path zu deinem Battleye Ordner führen. In meinem Beispiel bei meinem Linux Server: -bepath=/home/gameserver/Steam/steamapps/common/server1/battleye/. Und in dem Ordner battleye sollte deine beserver.so oder beserver.exe mit deiner beserver.cfg liegen.
Wird deine beserver.cfg automatisch umbenannt? Zum Beispiel in: beserver_active_1ce9399c.cfg?
Wenn du mir sagen kannst wo ich das nochmal einstellen kann genau kann ich es dir vlt sagen
Arma 3: Startup Parameters - Bohemia Interactive Community (bistudio.com)
Die "Commandline" womit du den Server startest sollte ein Parameter, der in ca. so aussieht, haben -bepath=<path> (logischerweise mit einem richtigen Pfad)
Der Parameter gibt den Pfad zum BE Ordner an, indem du eine beserver_x64.cfg (ohne _x64, wenn du in 32 Bit startest) haben solltest.
Du könntest mal schauen, ob du evtl. 2306 als Standard RCON Port verwendest.
Ein log vom Server wäre auch super da hätte man sich die frage nach z.b. dem Pfad oder andere Parameter sparen können.
Solange der Pfad für battleye nicht verändert wird, ist der Parameter -bepath <PATH> nicht notwendig und überflüssig. Solange die Datei an der richtigen Stelle liegt.
Bei Windows: <ARMAPATH>\battleye\beserver.cfg (bitte um Bestätigung)
Bei Linux: <ARMAPATH>/battleye/launch/beserver.cfg
Wichtig ist, dass die beserver.cfg abhängig der Architektur benannt wird.
Bei 32 Bit: beserver.cfg
Bei 64 Bit: beserver_x64.cfg
